Valdymo srities įstaigos
Biudžetinės įstaigos
- Įstaigos prie Žemės ūkio ministerijos, kuriose ministerija įgyvendina savininko teises ir pareigas
- Nacionalinė mokėjimo agentūra prie Žemės ūkio ministerijos
- Žuvininkystės tarnyba prie Lietuvos Respublikos Žemės ūkio ministerijos
- Valstybinė augalininkystės tarnyba prie Žemės ūkio ministerijos
- Žemės ūkio agentūra prie Žemės ūkio ministerijos
- Nacionalinis maisto ir veterinarijos rizikos vertinimo institutas
Viešosios įstaigos
Valstybės įmonės ir valstybės valdomos bendrovės
- Valstybės įmonė, kurioje ministerija įgyvendina savininko teises ir pareigas
- Uždarosios akcinės bendrovės ir akcinės bendrovės, kuriose ministerija yra akcijų valdytoja