5. Departamento pagrindiniai uždaviniai:

5.1. formuoti valstybės politiką žuvininkystės srityje, organizuoti, koordinuoti ir kontroliuoti jos įgyvendinimą;

5.2. dalyvauti formuojant Europos Sąjungos (toliau – ES) bendrąją žuvininkystės politiką, integruotą regioninę žuvininkystės politiką, organizuoti, koordinuoti ir kontroliuoti jų įgyvendinimą Lietuvoje;

5.3. pagal kompetenciją dalyvauti formuojant vidaus vandenų žuvų išteklių išsaugojimo ir atkūrimo politiką, organizuojant, koordinuojant ir kontroliuojant jos įgyvendinimą;

5.4. formuoti ES finansinės paramos žuvininkystei (toliau – ES paramos) Lietuvos žuvininkystės sektoriui prioritetus ir užtikrinti efektyvų ES paramos lėšų panaudojimą Lietuvos žuvininkystės sektoriui.

6. Departamentas atlieka šias specialiąsias funkcijas:

6.1. rengia nacionalines žuvininkystės duomenų rinkimo ir Lietuvos žuvininkystės kontrolės programas, koordinuoja ir kontroliuoja jų įgyvendinimą;

6.2. formuoja ir tobulina duomenų apie žuvininkystės sektorių rinkimo metodikas;

6.3. formuoja nacionalinės paramos žuvininkystės sektoriui politiką, organizuoja ir koordinuoja jos įgyvendinimą;

6.4. inicijuoja Lietuvos Respublikos prisijungimą prie žuvininkystės veiklą reglamentuojančių tarptautinių susitarimų, koordinuoja šių susitarimų vykdymą Lietuvoje, siekia užtikrinti Lietuvos žvejybos laivynui žvejybos galimybes ir palankias veiklos sąlygas pagal ES susitarimus su trečiosiomis valstybėmis bei regioninėse žuvininkystės valdymo organizacijose;

6.5. analizuoja žuvininkystės sektorių, rengia žuvininkystės sektoriaus ekonominės ir socialinės būklės apžvalgas, pagal kompetenciją planuoja ir inicijuoja mokslo tiriamuosius darbus, teikia siūlymus dėl mokslo ir mokymo žuvininkystės sektoriuje politikos formavimo bei dalyvauja ją įgyvendinant;

6.6. teikia siūlymus dėl žuvininkystės produktų gamybos ir prekybos skatinimo ir ekonominio reguliavimo priemonių (subsidijų, kvotų, akcizų, mokesčių, kreditų, muitų ir kt.) taikymo;

6.7. inicijuoja tarptautinius ir nacionalinius projektus žuvininkystės sektoriuje, dalyvauja juos įgyvendinant;

6.8. užtikrina ES teisės (acquis communautaire) žuvininkystės srityje perkėlimą į Lietuvos Respublikos nacionalinę teisę, rengia nacionalines ES bendrosios žuvininkystės politikos įgyvendinimo priemones, koordinuoja ir kontroliuoja jų vykdymą;

6.9. rengia ir derina Lietuvos Respublikos pozicijas ES institucijose nagrinėjamais žuvininkystės srities klausimais, užtikrina efektyvų atstovavimą Lietuvos Respublikos interesams ES institucijose;

6.10. koordinuoja žuvininkystės atašė Lietuvos nuolatinėje atstovybėje Europos Sąjungoje veiklą Lietuvos pozicijų žuvininkystės srityje rengimo ir atstovavimo klausimais;

6.11. pagal kompetenciją dalyvauja ES Tarybos darbo grupių, Europos Komisijos komitetų ir kitų ES institucijų darbo organų posėdžiuose ir pristato juose Lietuvos Respublikos poziciją;

6.12. palaiko ryšius su ES valstybių narių ir trečiųjų valstybių institucijomis, tarptautinėmis ir regioninėmis žuvininkystės organizacijomis, mokslo bei mokymo institucijomis, tiesiogiai bei ES delegacijų sudėtyje atstovauja jose Lietuvos Respublikai;

6.13. kaupia, analizuoja ir apibendrina esamą mokslinę ir praktinę informaciją apie Lietuvos žvejybos laivų pagrindinių žvejojamų rūšių žuvų būklę;

6.14. rengia nacionalines žuvivaisos programas, koordinuoja jų įgyvendinimą;

6.15. rengia perleidžiamųjų teisių į žvejybos vidaus vandenyse kvotas suteikimo ir verslinės žvejybos vidaus vandenyse kvotų skyrimo tvarkos aprašus, koordinuoja ir kontroliuoja jų įgyvendinimą;

6.16. rengia ir derina su Europos Komisija ES paramos Lietuvos žuvininkystės sektoriui programinius dokumentus, jų priedus ar dalis, inicijuoja, rengia ir derina su Europos Komisija ES paramos Lietuvos žuvininkystės sektoriui programinių dokumentų, jų priedų ar dalių keitimus ir papildymus;

6.17. atlieka ES paramos programų vadovaujančiosios institucijos funkcijas;

6.18. rengia ES paramos Lietuvos žuvininkystės sektoriui administravimo dokumentus, jų pakeitimus ir papildymus bei kitus su ES paramos Lietuvos žuvininkystės sektoriui administravimu susijusius dokumentus;

6.19. organizuoja ES paramos Lietuvos žuvininkystės sektoriui programų stebėsenos, valdymo, projektų atrankos ir vietos plėtros strategijų atrankos komitetų darbą;

6.20. vykdo ES paramos Lietuvos žuvininkystės sektoriui įgyvendinimo stebėseną, inicijuoja ir rengia vertinimus, ataskaitas apie ES paramos Lietuvos žuvininkystės sektoriui įsisavinimą;

6.21. planuoja ir įgyvendina ES paramos Lietuvos žuvininkystės sektoriaus viešinimo bei visuomenės informavimo apie šią paramą veiksmus;

6.22. užtikrina ES paramos Lietuvos žuvininkystės sektoriui programų techninės paramos tinkamą administravimą;

6.23. pagal kompetenciją atlieka funkcijas, susijusias su ankstesniais ir vėlesniais ES paramos programiniais laikotarpiais, siekiant užtikrinti žuvininkystės politikos tęstinumą bei sklandų perėjimą iš vieno programinio laikotarpio į kitą.