7. Skyriaus veiklos tikslas – padėti ministrui siekti viešojo juridinio asmens veiklos tikslo (-ų) tobulinant viešojo juridinio asmens valdymą, rizikos valdymą ir vidaus kontrolę.
8. Skyriaus veiklos uždavinys – atlikti ministerijos, jai pavaldžių ir (arba) atskaitingų viešųjų juridinių asmenų vidaus auditą, kurio pagrindiniai uždaviniai yra:
8.1. tirti ir vertinti ministerijos valdymą, rizikos valdymą ir vidaus kontrolę;
8.2. tirti ir vertinti ministerijos, jai pavaldžių ir (arba) atskaitingų viešųjų juridinių asmenų gautų Europos Sąjungos ir (arba) tarptautinės finansinės paramos lėšų panaudojimo administravimą;
8.3. teikti žemės ūkio ministrui rekomendacijas dėl ministerijos, jai pavaldžių ir (arba) atskaitingų viešųjų juridinių asmenų valdymo, rizikos valdymo ir vidaus kontrolės tobulinimo;
8.4. konsultuoti žemės ūkio ministrą, ministerijos administracijos padalinių ir (ar) ministerijai pavaldžių ir (arba) atskaitingų viešųjų juridinių asmenų vadovus viešojo juridinio asmens valdymo, rizikos valdymo ir vidaus kontrolės klausimais.
9. Skyrius, siekdama jam nustatyto veiklos tikslo (-ų), atlieka šias funkcijas:
9.1. vertina, kaip ministerija, jai pavaldūs ir (arba) atskaitingi viešieji juridiniai asmenys:
9.1.1. laikosi veiklą reglamentuojančių teisės aktų reikalavimų;
9.1.2. įgyvendina strateginius planavimo dokumentus;
9.1.3. vykdo veiklą ekonomiškumo, efektyvumo ir rezultatyvumo požiūriu;
9.1.4. valdo riziką: nustato, analizuoja rizikos veiksnius ir parenka priemones, kurios sumažintų arba pašalintų neigiamą poveikį viešojo juridinio asmens veiklai;
9.1.5. valdo, naudoja turtą ir disponuoja juo, saugo jį nuo neteisėtų veikų, atlieka turto apskaitą;
9.1.6. užtikrina teikiamos informacijos apie finansinę ir kitą veiklą patikimumą, aktualumą, išsamumą ir teisingumą;
9.1.7. užtikrina informacinių sistemų valdymą ir saugumą;
9.2. vertina ministerijos, jai pavaldžių ir (arba) atskaitingų viešųjų juridinių asmenų gautų Europos Sąjungos ir (arba) tarptautinės finansinės paramos lėšų panaudojimo administravimą, teikia išvadas ir rekomendacijas dėl jos tobulinimo;
9.3. atlieka korupcijos rizikos valdymo vertinimą;
9.4. vykdo Europos jūros reikalų ir žuvininkystės fondo (toliau – EJRŽF) audito institucijos funkcijas:
9.4.1. vadovaudamasis tarptautiniais audito standartais, atlieka Europos Komisijai deklaruotų išlaidų atrankinius patikrinimus, valdymo ir kontrolės sistemos, sąskaitų bei lėšų auditą arba užtikrina minėtų funkcijų atlikimo organizavimą ir priežiūrą;
9.4.2. remdamasis atliktų auditų ir deklaruotų išlaidų atrankinių patikrinimų rezultatais, kasmet rengia ir teikia Europos Komisijai nuomones dėl valdymo ir kontrolės sistemos funkcionavimo, sąskaitų ir Europos Komisijai teikiamų išlaidų deklaracijų teisingumo;
9.4.3. rengia ir teikia Europos Komisijai baigiamąją audito deklaraciją.
9.5. vykdo Europos žemės ūkio fondo kaimo plėtrai (toliau – EŽŪFKP) ir Europos žemės ūkio garantijų fondo (toliau – EŽŪGF) kompetentingosios institucijos funkcijas:
9.5.1. atlieka arba organizuoja Nacionalinės mokėjimo agentūros prie Žemės ūkio ministerijos (toliau – Agentūra) atitikties akreditavimo kriterijams patikrinimą;
9.5.2. teikia siūlymus dėl Agentūros akreditavimo arba akreditacijos panaikinimo bei Lietuvos Respublikos ir ES teisės aktų nustatyta tvarka ir terminais apie tai informuoja Europos Komisiją;
9.5.3. atlieka Agentūros atitikties akreditavimo kriterijams priežiūrą ir kas trejus metus informuoja Europos Komisiją apie jos rezultatus;
9.6. užtikrina EŽŪGF ir EŽŪFKP sertifikavimo įstaigos funkcijų atlikimą:
9.6.1. remdamasis tarptautiniais audito standartais ir atsižvelgdamas į Europos Komisijos nustatytas gaires, atlieka ministerijos ir Agentūros auditą, išlaidų patikrinimus, būtinus šių nuostatų 9.6.2 papunktyje nurodytiems dokumentams parengti, arba užtikrina minėtų funkcijų atlikimo organizavimą ir priežiūrą;
9.6.2. užtikrina išvados dėl Agentūros metinių finansinių ataskaitų ir kitų Europos Komisijos reikalaujamų dokumentų parengimą ir pateikimą Europos Komisijai;
9.7. rengia vidaus audito ataskaitas, kuriose teikia išvadas ir rekomendacijas dėl ministerijos, jai pavaldžių ir (arba) atskaitingų viešųjų juridinių asmenų valdymo, rizikos valdymo ir vidaus kontrolės tobulinimo;
9.8. atlieka pažangos stebėjimą: stebi ir vertina, kaip įgyvendinamos vidaus audito ataskaitose pateiktos rekomendacijos;
9.9. koordinuoja Europos Komisijos ir ES audito rūmų atstovų darbo vizitus;
9.10. pagal poreikį teikia informaciją Lietuvos Respublikos valstybės kontrolei (toliau –Valstybės kontrolė) dėl jos atliekamų veiklos ir finansinių auditų, taip pat vykdo Valstybės kontrolės pateiktų rekomendacijų įgyvendinimo kontrolę;
9.11. rengia ir teikia konsultacijas ministerijos valdymo, rizikos valdymo ir vidaus kontrolės klausimais žemės ūkio ministrui, ministerijos administracijos padalinių ir (ar) viešajam juridiniam asmeniui pavaldžių ir (arba) atskaitingų viešųjų juridinių asmenų vadovams;
9.12. rengia skyriaus veiklos planus ir metinę skyriaus veiklos ataskaitą;
9.13. atlieka kitas teisės aktuose nurodytas funkcijas, susijusias su skyriaus veiklos tikslo (-ų) įgyvendinimu.